105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4709 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  55.87 
 
 
305 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  55.52 
 
 
305 aa  311  9e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  54.3 
 
 
305 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  55.99 
 
 
305 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  55.28 
 
 
305 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  55.28 
 
 
305 aa  309  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  40.69 
 
 
301 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  41.46 
 
 
290 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  39.53 
 
 
292 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  34.38 
 
 
286 aa  169  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  35.62 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  35.62 
 
 
290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  38.91 
 
 
294 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  39.52 
 
 
312 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  37.59 
 
 
473 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
348 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 
317 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  36.27 
 
 
417 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  36.27 
 
 
336 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  37.41 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  37.77 
 
 
302 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  35.59 
 
 
336 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  37.01 
 
 
327 aa  149  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  37.33 
 
 
346 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  35.74 
 
 
291 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  35.36 
 
 
303 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  36.52 
 
 
357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 
346 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 
346 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  37.24 
 
 
302 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  36.03 
 
 
352 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  36.62 
 
 
325 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  37.11 
 
 
462 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  37.09 
 
 
300 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  35.02 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  37.11 
 
 
295 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  37.11 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  37.11 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  37.11 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  37.11 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  37.11 
 
 
293 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  34.66 
 
 
291 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  34.72 
 
 
298 aa  142  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  36.62 
 
 
325 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  35.66 
 
 
300 aa  135  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.53 
 
 
291 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  33.1 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  34.86 
 
 
293 aa  132  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  32.85 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  34.21 
 
 
300 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  29.77 
 
 
297 aa  124  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  34.53 
 
 
298 aa  124  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  34.63 
 
 
306 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  33.2 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  28.81 
 
 
321 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  33.92 
 
 
306 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  26.67 
 
 
287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  26.6 
 
 
288 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  30.32 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  36.43 
 
 
330 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  34.53 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  28.78 
 
 
285 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  29.48 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 
301 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  29.03 
 
 
284 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  34.44 
 
 
316 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 
311 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0893  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  32.2 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  34.96 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  28.45 
 
 
310 aa  51.6  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
288 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  36.94 
 
 
312 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  34.51 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
314 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1156  hypothetical protein  37.04 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.40892  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
267 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  36.45 
 
 
345 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.48 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  26.45 
 
 
348 aa  45.8  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  26.32 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1597  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  34.48 
 
 
294 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  30.25 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  23.36 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  28.22 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  24.22 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  29.24 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  27.08 
 
 
316 aa  43.1  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>