84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2212 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  624  1e-178  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  67.57 
 
 
321 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  50.36 
 
 
287 aa  311  6.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  49.63 
 
 
288 aa  295  8e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
289 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  35.46 
 
 
289 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 
291 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  33.45 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  33.46 
 
 
328 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  33.86 
 
 
291 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  31.5 
 
 
305 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  31.5 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.96 
 
 
286 aa  146  5e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  29.37 
 
 
290 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  29.33 
 
 
292 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  29.07 
 
 
285 aa  142  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  31.64 
 
 
300 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  31.73 
 
 
305 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  30.77 
 
 
305 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  30.77 
 
 
305 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  30.29 
 
 
305 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  29.15 
 
 
296 aa  135  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  30.46 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  30.13 
 
 
462 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  30.46 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  30.46 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  30.46 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  30.13 
 
 
293 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  30.46 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  29.03 
 
 
298 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  29.47 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  30.3 
 
 
298 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  30.07 
 
 
294 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  29.33 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  28.26 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  30.8 
 
 
312 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
317 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  29.97 
 
 
295 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  29.97 
 
 
295 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  30.3 
 
 
298 aa  122  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 
327 aa  122  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  27.27 
 
 
336 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  27.27 
 
 
417 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  29.28 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  26.55 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  26.55 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  26.55 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  26.55 
 
 
336 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  27.73 
 
 
303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  27.1 
 
 
302 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  27.2 
 
 
328 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  26.42 
 
 
357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  29.79 
 
 
306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  26.89 
 
 
291 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  29.45 
 
 
306 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
348 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  26.34 
 
 
314 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  26.55 
 
 
346 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  25.55 
 
 
346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  26.33 
 
 
352 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 
325 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  25.55 
 
 
346 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
300 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  25.55 
 
 
346 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  26.94 
 
 
300 aa  102  7e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  26.87 
 
 
325 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  25.93 
 
 
290 aa  89  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  25.93 
 
 
290 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  25 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  25.49 
 
 
301 aa  62.4  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
334 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  23.24 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  25.28 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3355  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  24.86 
 
 
278 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  25.66 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
288 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  24.85 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  28.18 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1748  hypothetical protein  27.21 
 
 
251 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  24.62 
 
 
341 aa  42.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>