214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1341 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1341  putative hydrolase  100 
 
 
300 aa  608  1e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0596  putative hydrolase  71.58 
 
 
298 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0575  putative hydrolase  71.58 
 
 
298 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0815  putative hydrolase  68.95 
 
 
298 aa  381  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40820  putative hydrolase  48.5 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3462  putative hydrolase  47.37 
 
 
291 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.339923  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0808  hypothetical protein  37.69 
 
 
285 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00976323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1464  hypothetical protein  32.48 
 
 
328 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0797  putative hydrolase  38.6 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0316  Alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
317 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151069  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4496  alpha/beta hydrolase-like protein  39.37 
 
 
302 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4634  hypothetical protein  38.43 
 
 
314 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0205  alpha/beta hydrolase  37.27 
 
 
328 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1918  alpha/beta hydrolase  39.11 
 
 
325 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0805  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
302 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
300 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1984  alpha/beta hydrolase  38.38 
 
 
327 aa  159  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00524  alpha/beta hydrolase-like protein  30.11 
 
 
288 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0569  alpha/beta hydrolase  39.29 
 
 
325 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1897  alpha/beta hydrolase-like protein  31.48 
 
 
321 aa  148  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.249943  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0438  hypothetical protein  37.32 
 
 
312 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4058  alpha/beta hydrolase-like protein  35.17 
 
 
292 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2192  alpha/beta hydrolase  34.85 
 
 
346 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.457111  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2214  alpha/beta hydrolase  35.5 
 
 
357 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1273  hypothetical protein  32.47 
 
 
296 aa  143  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0496483  hitchhiker  0.00827301 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1095  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
348 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2212  hypothetical protein  31.64 
 
 
297 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.140894 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2091  alpha/beta hydrolase  35.98 
 
 
352 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5485  Alpha/beta hydrolase  35.14 
 
 
346 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0548  hypothetical protein  35.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.491359  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3029  hypothetical protein  35.82 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5902  alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 
346 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.169357  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2175  alpha/beta hydrolase  34.47 
 
 
346 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1265  hypothetical protein  35.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00885366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0605  hypothetical protein  35.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1460  alpha/beta fold family hydrolase  35.82 
 
 
293 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1490  alpha/beta fold family hydrolase  35.82 
 
 
462 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.679445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1594  alpha/beta fold family hydrolase  35.82 
 
 
293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1457  alpha/beta hydrolase  33.47 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2079  hypothetical protein  35.13 
 
 
301 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1964  hypothetical protein  33.58 
 
 
291 aa  138  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0677628  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3867  alpha/beta hydrolase-like protein  33.33 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2873  alpha/beta hydrolase  37.98 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.723814  normal  0.157524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2795  hypothetical protein  35.07 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0611315  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5870  alpha/beta hydrolase-like protein  32.43 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4327  alpha/beta hydrolase-like protein  33.33 
 
 
305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2728  hypothetical protein  34.31 
 
 
336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0371718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2670  hypothetical protein  34.31 
 
 
417 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3610  Alpha/beta hydrolase  37.22 
 
 
289 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0643  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.107821  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0427  alpha/beta hydrolase fold  37.22 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1684  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2369  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.841526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2916  hypothetical protein  33.94 
 
 
336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.282253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0520  hypothetical protein  28.26 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01912  hypothetical protein  33.7 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1527  alpha/beta hydrolase-like  32.21 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.114402 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3931  alpha/beta hydrolase-like  31.08 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269531  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4435  alpha/beta hydrolase-like protein  31.08 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4709  alpha/beta hydrolase-like protein  34.21 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0396894  decreased coverage  0.00396778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1818  hypothetical protein  34.18 
 
 
473 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3632  alpha/beta hydrolase-like protein  34.21 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0686  hypothetical protein  30.5 
 
 
286 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0130174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21420  predicted alpha/beta hydrolase  33.46 
 
 
300 aa  119  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  33.69 
 
 
294 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47510  putative hydrolase  34.51 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3622  alpha/beta hydrolase fold protein  38.8 
 
 
301 aa  90.1  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2996  alpha/beta hydrolase-like protein  28.97 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3343  alpha/beta hydrolase-like protein  28.97 
 
 
306 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1672  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324929  normal  0.537045 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2936  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_004310  BR0288  hypothetical protein  30.74 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0301  hypothetical protein  30.74 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1678  hypothetical protein  32.72 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3956  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
334 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00786101  normal  0.0406632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1504  hypothetical protein  29.75 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0349086  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3679  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.47 
 
 
279 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  35.77 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  25.4 
 
 
267 aa  59.3  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2606  alpha/beta hydrolase  28.4 
 
 
278 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal  0.690565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
317 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  33.33 
 
 
308 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 
281 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
270 aa  55.8  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
311 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  27.74 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  40.48 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 
307 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  28.38 
 
 
316 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  29.69 
 
 
307 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
314 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  29.09 
 
 
280 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  28.68 
 
 
307 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.07 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  25.6 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>