273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1390 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  638    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  41.1 
 
 
307 aa  229  6e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
307 aa  229  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  40.39 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  40.78 
 
 
307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  37.7 
 
 
304 aa  227  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  40.58 
 
 
307 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  40.78 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 
327 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  40.45 
 
 
307 aa  224  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  39.87 
 
 
307 aa  222  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  36.75 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  35.41 
 
 
314 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  39.48 
 
 
307 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 
307 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  39.16 
 
 
307 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
314 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  34.43 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
314 aa  208  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  35.55 
 
 
314 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  35.41 
 
 
316 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 
326 aa  202  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  36.79 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  34.75 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  34.75 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  35.08 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
326 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
306 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  31.92 
 
 
291 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  29.53 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  33.01 
 
 
308 aa  172  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  30.03 
 
 
313 aa  171  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  35.12 
 
 
309 aa  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  31.69 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  31.69 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  30.56 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
317 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
305 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
305 aa  155  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
306 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  28.52 
 
 
314 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  30.92 
 
 
301 aa  153  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
311 aa  146  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  31.27 
 
 
310 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 
310 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  28.01 
 
 
316 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  28.04 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  27.68 
 
 
308 aa  135  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  29.21 
 
 
309 aa  135  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  30.43 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  29.9 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  27.6 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
335 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.64 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.64 
 
 
279 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  25.96 
 
 
279 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.71 
 
 
277 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.27 
 
 
277 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 
276 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 
278 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  24.66 
 
 
286 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.03 
 
 
279 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
267 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  26.49 
 
 
279 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
284 aa  96.3  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
270 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  24.33 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  25.79 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 
302 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
302 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  22.74 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  25.16 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  25.47 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  25.48 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  27.27 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  26.6 
 
 
277 aa  89  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  24.84 
 
 
288 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 
320 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
302 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  24.52 
 
 
306 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  23.88 
 
 
275 aa  87.4  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  24.28 
 
 
318 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  26.46 
 
 
278 aa  86.3  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.27 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  24.25 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  24.92 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  23.1 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>