150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  100 
 
 
308 aa  641    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  42.24 
 
 
310 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  33.67 
 
 
310 aa  149  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  30.99 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  31.54 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  29.81 
 
 
310 aa  127  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  29.15 
 
 
304 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  28.57 
 
 
301 aa  120  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  27.3 
 
 
308 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 
310 aa  119  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  29.62 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  27.07 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  27.54 
 
 
309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
306 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  26.58 
 
 
308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  28.91 
 
 
307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  30.63 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
307 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
307 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  29.27 
 
 
307 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
307 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  28.42 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  28.12 
 
 
307 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  29.04 
 
 
316 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  28.52 
 
 
308 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  28.09 
 
 
334 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
314 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  28.81 
 
 
314 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  28.81 
 
 
323 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
314 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  28.77 
 
 
316 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  27.36 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  27.78 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
314 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  27.56 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  24.24 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  24.92 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  26.24 
 
 
314 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1660  lysophospholipase  34.17 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.631285  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  23.99 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  25.93 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  26.67 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  25.42 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  25.42 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  23.63 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  24.38 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  25.65 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  25.86 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
277 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  27.57 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  22.22 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  25.42 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
302 aa  65.9  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  25.98 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  24.35 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  24.91 
 
 
279 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
275 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
253 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1664  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
341 aa  62.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
345 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  24.47 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  23.47 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  25.96 
 
 
288 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 
338 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  27.71 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  25.5 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  22.3 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
291 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  36.36 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
290 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
291 aa  54.7  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  24.49 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>