More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2119 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  59.06 
 
 		 314 aa  352  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  56.11 
 
 		 309 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  52.81 
 
 		 316 aa  318  6e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  49.3 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  46.03 
 
 		 314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  46.03 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  47.4 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  42.37 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  34.48 
 
 		 307 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  32.76 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 307 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  32.99 
 
 		 307 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  32.76 
 
 		 307 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  32.07 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  34.14 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  32.39 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  32.39 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  32.07 
 
 		 307 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 308 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  30.43 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  33.45 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  34.01 
 
 		 316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  33.81 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  33.57 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  30.43 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 306 aa  138  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  27.3 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  27.67 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  29.43 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  34.48 
 
 		 291 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  24.33 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  26.12 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  28.09 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  32.06 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  28.09 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.66 
 
 		 318 aa  93.2  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.09 
 
 		 277 aa  92.4  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.89 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  33.65 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 		 303 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  33.65 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  33.77 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  33.77 
 
 		 280 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 335 aa  87.4  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  32.37 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.07 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  29.33 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  28.43 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  28.43 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  28.76 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  26.62 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  25.57 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  33.65 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  29.79 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.75 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  26.69 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  26.24 
 
 		 308 aa  76.6  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  25.48 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  32.98 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  33.33 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.775525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>