More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2367 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
286 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  47.27 
 
 
279 aa  192  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  39.42 
 
 
277 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  44 
 
 
277 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  44.62 
 
 
288 aa  187  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  43.63 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  42.91 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  42.91 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  42.91 
 
 
279 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  44.91 
 
 
288 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  37.64 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  38.97 
 
 
303 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  38.97 
 
 
303 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  38.97 
 
 
303 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  38.62 
 
 
303 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  33.46 
 
 
277 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  40.86 
 
 
280 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  33.09 
 
 
277 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  40.86 
 
 
280 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
277 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  38.62 
 
 
303 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  33.7 
 
 
280 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  40.93 
 
 
302 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
320 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
302 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
302 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
302 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  31.82 
 
 
279 aa  152  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 
278 aa  148  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  38.61 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  37.29 
 
 
318 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 
284 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 
281 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  37.59 
 
 
559 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
315 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  36.4 
 
 
301 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  33.85 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  35.98 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  36.78 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  38.93 
 
 
278 aa  125  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  31.27 
 
 
306 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  37.65 
 
 
274 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
253 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  36.3 
 
 
265 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  35.86 
 
 
279 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
289 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  36.04 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
263 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
291 aa  113  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  33.69 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  36.05 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  35.94 
 
 
290 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  31.85 
 
 
316 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  38.49 
 
 
291 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  34.13 
 
 
289 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 
257 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
257 aa  106  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
250 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 
314 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
314 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
289 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  31.38 
 
 
316 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
328 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  34.52 
 
 
286 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 
314 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.96 
 
 
268 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  28.24 
 
 
267 aa  101  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  28.63 
 
 
267 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
254 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 
310 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
254 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
267 aa  100  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  28.98 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  28.98 
 
 
272 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  28.98 
 
 
267 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  28.98 
 
 
267 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  28.98 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  28.98 
 
 
267 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  29.08 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7836  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 
300 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  28.98 
 
 
277 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  32.69 
 
 
310 aa  96.3  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
306 aa  95.5  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
326 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
255 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
330 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
327 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  27.67 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31753  predicted protein  28.07 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
307 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>