297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4551 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  99.36 
 
 		 314 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 314 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  94.27 
 
 		 314 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  87.58 
 
 		 314 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  66.88 
 
 		 314 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  68.2 
 
 		 316 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  66.89 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  64.65 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  44.91 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  37.58 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  36.09 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  37.79 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  38.94 
 
 		 304 aa  229  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  36.91 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  37.58 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  37.58 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  36.58 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  36.58 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  36.58 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  36.24 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  36 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  41.42 
 
 		 306 aa  220  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  36.33 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  34.44 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  37.54 
 
 		 316 aa  196  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  35.43 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  40.48 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  36 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  36 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  36.24 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 314 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  34.77 
 
 		 308 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  31.65 
 
 		 301 aa  176  7e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  28.71 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  29.49 
 
 		 309 aa  169  7e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  33.45 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  34.51 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 310 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  33.22 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  29.41 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 		 305 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  32.51 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  27.67 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.42 
 
 		 276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  30.95 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  30.95 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.03 
 
 		 279 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.93 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  29.17 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  31.38 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  28.57 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  27.99 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 286 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  27.8 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  29.66 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 270 aa  99.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  31.51 
 
 		 288 aa  99.4  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 275 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  25.43 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.66 
 
 		 277 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 277 aa  96.3  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.74 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  23.7 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 278 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.42 
 
 		 279 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 		 306 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 302 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0801  Lysophospholipase-like protein  23.47 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 		 284 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  28.98 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.15 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  28.81 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1666  alpha/beta hydrolase fold protein  27.15 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.993525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  28.34 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  27.36 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  27.36 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 254 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.42 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  27.74 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>