More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1494 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 326 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  72.35 
 
 		 316 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  72.03 
 
 		 316 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  67.52 
 
 		 314 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  64.65 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  64.33 
 
 		 314 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  64.65 
 
 		 314 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  63.06 
 
 		 314 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  44.12 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  40.8 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  38.38 
 
 		 307 aa  239  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  38.13 
 
 		 307 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  38.38 
 
 		 307 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  38.05 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  38.33 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  38.05 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  38.28 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 307 aa  231  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  37.37 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  36.7 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  39.27 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  38.87 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  35.62 
 
 		 313 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 317 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  38 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  35.26 
 
 		 310 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  39.33 
 
 		 323 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  39.33 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  36.48 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  37.21 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  38.18 
 
 		 291 aa  189  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  31.58 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  35.79 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  35.64 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  29.9 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  29.18 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  33.44 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  29.58 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  32.57 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  30.8 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  31.69 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 298 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  31.39 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  31.88 
 
 		 279 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  31.88 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  31.88 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  30.18 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl474  lysophospholipase  25.41 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  32.41 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 267 aa  103  4e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  28.71 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  30.82 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  28.37 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  30.69 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  30.82 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 284 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  30.49 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  31.42 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  30.19 
 
 		 280 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  30.16 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  30.96 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.54 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 		 275 aa  93.2  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  29.32 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 		 302 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  32.53 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  29.18 
 
 		 301 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 306 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  27.46 
 
 		 277 aa  87  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  26.17 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  40.31 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  25.55 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>