More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2041 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
306 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
314 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  41.42 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  41.42 
 
 
314 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 
314 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4355  Alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 
314 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21320  hypothetical protein  41.12 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.964841  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2528  alpha/beta hydrolase fold protein  45.42 
 
 
327 aa  209  5e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.757367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
326 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1823  hypothetical protein  40.33 
 
 
316 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1861  hydrolase, alpha/beta fold family  35.53 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1701  alpha/beta fold family hydrolase  35.53 
 
 
307 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1976  hydrolase, alpha/beta fold family  35.22 
 
 
307 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3481  hydrolase, alpha/beta fold family  34.54 
 
 
307 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1676  alpha/beta fold family hydrolase  34.87 
 
 
307 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1898  hydrolase, alpha/beta fold family  35.2 
 
 
307 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1718  alpha/beta hydrolase fold  33.99 
 
 
307 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  32.9 
 
 
307 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1724  alpha/beta fold family hydrolase  34.54 
 
 
307 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1860  alpha/beta fold family hydrolase  34.54 
 
 
307 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1945  alpha/beta fold family hydrolase  34.22 
 
 
307 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 
304 aa  177  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1390  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
310 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3810  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
326 aa  168  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4031  putative lysophospholipase L2  39.67 
 
 
291 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1814  lysophospholipase  31.23 
 
 
310 aa  167  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  30.1 
 
 
313 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1032  alpha/beta hydrolase fold protein  35.84 
 
 
324 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.212267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1717  lysophospholipase L2  34.72 
 
 
314 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1956  alpha/beta fold family hydrolase  30.51 
 
 
308 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.374782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2244  alpha/beta fold family hydrolase  30.17 
 
 
306 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0726  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
310 aa  143  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0989591  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0898  lysophospholipase-like protein  29.87 
 
 
308 aa  142  7e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21580  lysophospholipase  32.44 
 
 
313 aa  142  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2034  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 
311 aa  142  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1458  hypothetical protein  34.45 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0738  lysophospholipase  29.37 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000217511  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1413  hypothetical protein  34.45 
 
 
323 aa  142  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2119  hypothetical protein  34.69 
 
 
314 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  0.48644 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2931  hypothetical protein  34.24 
 
 
316 aa  136  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0847  hypothetical protein  26.58 
 
 
301 aa  136  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.653287  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2622  hypothetical protein  36.03 
 
 
312 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3544  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.941882  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0869  alpha/beta fold family hydrolase  26.32 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381761  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2622  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal  0.924395 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl099  lysophospholipase  23.61 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12170  lysophospholipase  33 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2882  alpha/beta hydrolase fold protein  32.45 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355624  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1361  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000732277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1122  hydrolase  32.39 
 
 
310 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11180  lysophospholipase  28.77 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.529406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  32.79 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  32.79 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  32.79 
 
 
279 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
306 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
276 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 
277 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  36.16 
 
 
303 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
275 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  36.16 
 
 
303 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  35.83 
 
 
303 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  35.83 
 
 
303 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  36.09 
 
 
280 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 
302 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  28.03 
 
 
277 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  36.57 
 
 
294 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  36.09 
 
 
280 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
279 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  35.5 
 
 
303 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  31.97 
 
 
265 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  35.88 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  31.89 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.6 
 
 
306 aa  99  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  35.08 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 
268 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
267 aa  96.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  29.89 
 
 
277 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  34.87 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  33.66 
 
 
288 aa  95.9  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  29.8 
 
 
277 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 
286 aa  95.5  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  28.03 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
320 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.07 
 
 
274 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  32 
 
 
288 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 
278 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
281 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  34.21 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.08 
 
 
278 aa  89  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1050  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  32.39 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 
289 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>