More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2989 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
303 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  88.78 
 
 
301 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  72.79 
 
 
320 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  71.23 
 
 
302 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2871  alpha/beta fold family hydrolase  70.77 
 
 
303 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  67.22 
 
 
302 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  72.04 
 
 
306 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  67.22 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  67.22 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  74.54 
 
 
315 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0415  alpha/beta fold family hydrolase  70.42 
 
 
303 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2981  alpha/beta fold family hydrolase  70.42 
 
 
303 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  67.87 
 
 
318 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2932  alpha/beta fold family hydrolase  70.77 
 
 
303 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0935  alpha/beta fold family hydrolase  70.42 
 
 
303 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2559  alpha/beta fold family hydrolase  71.12 
 
 
280 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0214  alpha/beta fold family hydrolase  71.12 
 
 
280 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0938  alpha/beta hydrolase fold  72.79 
 
 
320 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1597  Acylglycerol lipase  40.58 
 
 
288 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  33.09 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0150  alpha/beta hydrolase fold  39.63 
 
 
279 aa  168  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0681813  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2790  alpha/beta hydrolase fold protein  37.18 
 
 
276 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.067584  normal  0.84932 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0518  acylglycerol lipase  36.8 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.645485  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2956  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10184  lysophospholipase  38.78 
 
 
279 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3672  Acylglycerol lipase  33.69 
 
 
279 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  41.57 
 
 
289 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0140  acylglycerol lipase  35.69 
 
 
279 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0149  acylglycerol lipase  35.69 
 
 
279 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.78006  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0130  acylglycerol lipase  35.69 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  38.04 
 
 
277 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0197  acylglycerol lipase  37.36 
 
 
288 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  36.86 
 
 
277 aa  149  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  36.08 
 
 
277 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  36.98 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 
306 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2367  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  35 
 
 
291 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  35.13 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1698  alpha/beta hydrolase fold protein  39.64 
 
 
559 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  hitchhiker  0.0000305694 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
281 aa  135  8e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
289 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3374  Alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 
290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3522  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.775525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3691  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
278 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  35.74 
 
 
286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
253 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
267 aa  124  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
257 aa  122  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
257 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1387  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.062595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0374  Acylglycerol lipase  30.57 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  36.17 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  35.52 
 
 
294 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4867  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
328 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4120  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.810632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3430  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
267 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  34.9 
 
 
278 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4367  Acylglycerol lipase  32.83 
 
 
265 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1513  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
250 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
268 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3478  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
291 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786791  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4492  lysophospholipase L2  28.02 
 
 
267 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  32.79 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4586  lysophospholipase L2  28.02 
 
 
267 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4895  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4654  hypothetical protein  28.02 
 
 
272 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5009  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  103  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4878  hypothetical protein  28.02 
 
 
267 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4904  hypothetical protein  27.63 
 
 
267 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4510  lysophospholipase L2  28.02 
 
 
277 aa  102  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.811294  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
263 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 
290 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4869  hypothetical protein  27.95 
 
 
267 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0371  hypothetical protein  27.56 
 
 
267 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
245 aa  99.4  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31710  lysophospholipase  31.82 
 
 
274 aa  98.6  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0248  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6100  predicted protein  30.08 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00681545  normal  0.399309 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2671  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
270 aa  96.7  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.661252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5281  alpha/beta hydrolase fold protein  34.77 
 
 
288 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2041  alpha/beta hydrolase fold protein  33.88 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1469  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443386  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31753  predicted protein  25 
 
 
382 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0196286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1494  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
326 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0365671  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
314 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1338  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51137  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5302  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289331  normal  0.304244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0547  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4551  alpha/beta fold family hydrolase  26.71 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0902601  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  28.41 
 
 
346 aa  82.4  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4058  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2146  alpha/beta fold family hydrolase  24.1 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3556  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.108163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0017  Lysophospholipase-like protein  31.07 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.953662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0367  lysophospholipase-like protein  24.61 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43352  predicted protein  25.96 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0470294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>