42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0371 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1239    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1988  hypothetical protein  56.67 
 
 
354 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09450  hypothetical protein  42.64 
 
 
348 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.513646  normal  0.860642 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0962  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  37.87 
 
 
364 aa  225  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06320  hypothetical protein  27.71 
 
 
352 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1399  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.64 
 
 
331 aa  92  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0801845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  21.25 
 
 
295 aa  65.1  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  23.55 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0072  hypothetical protein  26.54 
 
 
347 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000140127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  25.35 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.18 
 
 
259 aa  52  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  26.79 
 
 
301 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  20.22 
 
 
322 aa  50.8  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1234  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
335 aa  49.7  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.34416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  26.2 
 
 
280 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  25.52 
 
 
306 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0257  alpha/beta hydrolase  27.5 
 
 
319 aa  47.4  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0230215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0248  alpha/beta hydrolase  26.9 
 
 
319 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.78 
 
 
288 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  29.41 
 
 
415 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  24 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48210  putative hydrolase  24.83 
 
 
294 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000506825  normal  0.0564296 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  25.84 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  21.57 
 
 
282 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  27.33 
 
 
321 aa  45.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3117  putative lipoprotein  24.58 
 
 
389 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1457  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 
307 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.331552  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  30.43 
 
 
304 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  25 
 
 
402 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
296 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.27 
 
 
253 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  22.07 
 
 
254 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  26.32 
 
 
306 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3282  lipoprotein, putative  25.95 
 
 
383 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0307  alpha/beta hydrolase  26.4 
 
 
319 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  22.73 
 
 
297 aa  44.3  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  23.98 
 
 
275 aa  44.3  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0367  alpha/beta hydrolase fold  26.54 
 
 
306 aa  44.3  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00100514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 
281 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4620  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
300 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505321  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0672  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.77 
 
 
344 aa  43.9  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0529058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5015  alpha/beta hydrolase  25.89 
 
 
300 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0176237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>