15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0215 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  660    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  64.82 
 
 
306 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  49.82 
 
 
285 aa  295  1e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  49.48 
 
 
285 aa  291  9e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  49.8 
 
 
302 aa  262  6e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  27.08 
 
 
335 aa  108  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  26.3 
 
 
329 aa  108  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  23.59 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  23.63 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  23.55 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  25.35 
 
 
615 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  22.64 
 
 
323 aa  49.7  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  21.54 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  22.13 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  20.32 
 
 
333 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>