22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6232 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  80.42 
 
 
336 aa  558  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  72.07 
 
 
333 aa  500  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  68.06 
 
 
341 aa  474  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4220  hypothetical protein  33.21 
 
 
362 aa  138  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00877371  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  24.35 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  26.59 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  24.81 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  24.81 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  22.99 
 
 
337 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  25.48 
 
 
410 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  27.34 
 
 
366 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  25.27 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  29.55 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  21.54 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  22.16 
 
 
329 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  25.73 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  25.73 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  25.73 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  26.21 
 
 
400 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2498  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.25 
 
 
867 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0529  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.86 
 
 
634 aa  42.7  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>