27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3852 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  750    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 368 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497771  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1791  hypothetical protein  36.59 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1838  hypothetical protein  36.59 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1772  hypothetical protein  36.31 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4331  hypothetical protein  36.78 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  37.61 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  36.52 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  34.62 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  34.62 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  34.62 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  35.24 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  29.21 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  29.21 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  29.21 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  29.5 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  28.91 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  21.33 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  31.62 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  29.91 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  29.91 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  27.1 
 
 		 358 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 359 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.440148  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  35.16 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  25.56 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  29.55 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4418  hypothetical protein  26.27 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>