31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0385 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  78.42 
 
 
397 aa  626  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  64.23 
 
 
400 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0317  hypothetical protein  71.65 
 
 
219 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0768732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  28.62 
 
 
358 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  31.83 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  32.01 
 
 
416 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  32.01 
 
 
416 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  32.01 
 
 
416 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  30.86 
 
 
413 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  33.01 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  29.21 
 
 
377 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0318  hypothetical protein  80 
 
 
41 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168056  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  26.38 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  25.78 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  26.38 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  23.1 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1772  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1838  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1791  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2014  hypothetical protein  26.48 
 
 
368 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497771  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  30.58 
 
 
333 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4331  hypothetical protein  24.8 
 
 
367 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4418  hypothetical protein  26.09 
 
 
368 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425813  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  30.95 
 
 
336 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  29.21 
 
 
341 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  31.43 
 
 
868 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4418  hypothetical protein  26.81 
 
 
359 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  24.76 
 
 
295 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>