30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10300 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  818    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  64.23 
 
 
398 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  64.23 
 
 
398 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  64.23 
 
 
398 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  65.79 
 
 
397 aa  533  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0317  hypothetical protein  63.4 
 
 
219 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0768732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  26.32 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  31.99 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  31.99 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  31.99 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  30.54 
 
 
413 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  29.51 
 
 
410 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  29.55 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  28.91 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  24.15 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  24.78 
 
 
333 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  22.63 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  23.31 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0318  hypothetical protein  71.79 
 
 
41 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168056  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1791  hypothetical protein  27.85 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1772  hypothetical protein  27.85 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1838  hypothetical protein  27.85 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2014  hypothetical protein  27.35 
 
 
368 aa  57  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497771  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4331  hypothetical protein  26.27 
 
 
367 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  27.18 
 
 
333 aa  46.6  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  25.24 
 
 
336 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  26.21 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  28.81 
 
 
323 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  23.26 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1667  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  27.69 
 
 
283 aa  42.7  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.195418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>