18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0134 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  29.05 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  25.97 
 
 		 333 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  24.16 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  25.4 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  28.09 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  28.81 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4220  hypothetical protein  22.36 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00877371  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  22.45 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  25.32 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  28.33 
 
 		 314 aa  50.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  28.33 
 
 		 316 aa  49.7  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  22.64 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42666  predicted protein  31.14 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  26.26 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5395  hypothetical protein  28.24 
 
 		 541 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.407079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  28.81 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 285 aa  42.7  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>