25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1641 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  64.82 
 
 
316 aa  454  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  48.39 
 
 
285 aa  290  3e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  51.55 
 
 
302 aa  273  2.0000000000000002e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  27.51 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  25.26 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  27.63 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  26.28 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  25.94 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  22.45 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  24.25 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
316 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  22.27 
 
 
263 aa  46.2  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0371  hypothetical protein  26.32 
 
 
615 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0267  alpha/beta family hydrolase  35.82 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4374  lysophospholipase-like  27.97 
 
 
316 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.501415  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2069  lysophospholipase-like protein  22.41 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6652  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 
278 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.451286 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4903  hypothetical protein  25.42 
 
 
372 aa  43.5  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4734  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0525  alpha/beta hydrolase fold  20.32 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.720757 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3674  Acylglycerol lipase  20.49 
 
 
280 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>