14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1590 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  650    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  98.41 
 
 
314 aa  638    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  53.02 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  48.7 
 
 
335 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  45.63 
 
 
337 aa  326  3e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
285 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  24.83 
 
 
285 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  25.78 
 
 
302 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  26.03 
 
 
306 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  23.55 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  28.49 
 
 
323 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  27.73 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  24.63 
 
 
343 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  25.49 
 
 
336 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>