23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6417 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  80.42 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  75.3 
 
 		 333 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  70.18 
 
 		 341 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4220  hypothetical protein  32.43 
 
 		 362 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00877371  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  27.91 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  27.7 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  27.89 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  29.07 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  27.48 
 
 		 366 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  23.64 
 
 		 337 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  28.36 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  24.43 
 
 		 413 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  30.95 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  30.95 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  30.95 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  25.56 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  25.24 
 
 		 400 aa  44.3  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  27.27 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  27.27 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  27.27 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0200  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 251 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  43.5  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>