18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0248 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0248  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  693    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1343  hypothetical protein  48.56 
 
 
329 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.696789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1047  hypothetical protein  44.51 
 
 
335 aa  311  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1656  hypothetical protein  45.31 
 
 
314 aa  311  9e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1590  hypothetical protein  45.63 
 
 
316 aa  311  1e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1426  hypothetical protein  28.57 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0485353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1641  hypothetical protein  25.26 
 
 
306 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1762  hypothetical protein  26.33 
 
 
285 aa  102  8e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1705  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 
285 aa  96.3  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0215  hypothetical protein  23.59 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  22.99 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  25.32 
 
 
323 aa  52  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2252  dienelactone hydrolase  28.87 
 
 
229 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.359164  normal  0.352697 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  23.64 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  24.55 
 
 
333 aa  49.3  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  19.41 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  29.41 
 
 
333 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2007  hypothetical protein  28.42 
 
 
280 aa  43.1  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.513637  normal  0.995132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>