145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_42666 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_42666  predicted protein  100 
 
 
372 aa  769    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00293  Protein phosphatase methylesterase 1 (PME-1)(EC 3.1.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGN7]  41.03 
 
 
407 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0524951  normal  0.418605 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02890  structural constituent of ribosome, putative  37.04 
 
 
422 aa  166  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.197265  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_4675  predicted protein  34.19 
 
 
269 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 
258 aa  63.5  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5231  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 
293 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.688512  normal  0.344583 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
288 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 
390 aa  56.6  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
303 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 
302 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 
280 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  34.31 
 
 
408 aa  53.9  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
282 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  21 
 
 
421 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  30.15 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
286 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
262 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 
262 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 
289 aa  51.2  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  23.12 
 
 
293 aa  50.4  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
431 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0134  hypothetical protein  27.27 
 
 
323 aa  50.1  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
297 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
292 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  22 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
306 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  19.93 
 
 
250 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
369 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  25.6 
 
 
303 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 
310 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  25.37 
 
 
289 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  30.12 
 
 
284 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  25.44 
 
 
329 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
254 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.41 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
259 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
299 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33405  predicted protein  26.83 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.344054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0615  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
268 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.63 
 
 
275 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  27.43 
 
 
277 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
272 aa  47.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
302 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  28.81 
 
 
278 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  32.97 
 
 
303 aa  47  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
302 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.11 
 
 
278 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
308 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3846  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
314 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
294 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33182  predicted protein  28.77 
 
 
464 aa  46.6  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
299 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  27.38 
 
 
359 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1931  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
258 aa  46.2  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  27.36 
 
 
315 aa  46.2  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539161  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
306 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  24.39 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.85 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
287 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52615  predicted protein  31.15 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0440889  normal  0.692936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1696  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  25 
 
 
307 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_157  hydrolase, alpha/beta fold family  22.41 
 
 
277 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.379638  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
371 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_002936  DET0149  alpha/beta fold family hydrolase  21.71 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0891  alpha/beta hydrolase fold  25.23 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2537  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 
273 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  26.55 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  27.35 
 
 
324 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 
268 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0222  acylglycerol lipase  23.56 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  28.24 
 
 
269 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0810  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000484628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  26.88 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  22.14 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  30.33 
 
 
504 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1409  alpha/beta hydrolase fold protein  24.79 
 
 
278 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.539385 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
262 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0913  putative hydrolytic enzyme  31.73 
 
 
265 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>