26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12646 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  837    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  67.95 
 
 
416 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  67.95 
 
 
416 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  67.95 
 
 
416 aa  564  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  64.62 
 
 
410 aa  531  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  66.48 
 
 
366 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  37.61 
 
 
377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1838  hypothetical protein  31.76 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1791  hypothetical protein  31.76 
 
 
369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1772  hypothetical protein  31.76 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  30.54 
 
 
400 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2014  hypothetical protein  30.34 
 
 
368 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497771  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  29.7 
 
 
397 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  30.86 
 
 
398 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  30.86 
 
 
398 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  30.86 
 
 
398 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4331  hypothetical protein  32.71 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  27.95 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  27.12 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  28.4 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  27.83 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  27.66 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  24.43 
 
 
336 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4263  hypothetical protein  26.95 
 
 
359 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.440148  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6232  hypothetical protein  25.27 
 
 
343 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.256504 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl390  hydrolase  25.21 
 
 
324 aa  43.1  0.009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0649986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>