42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0423 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0373  hypothetical protein  77.89 
 
 
398 aa  650    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.601269  normal  0.560252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  812    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0385  hypothetical protein  77.89 
 
 
398 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.221885  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0394  hypothetical protein  77.89 
 
 
398 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.829067  normal  0.617571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10300  hypothetical protein  65.73 
 
 
400 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.134854  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0317  hypothetical protein  86.53 
 
 
219 aa  344  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0768732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2824  hypothetical protein  29.18 
 
 
358 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.404789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  30.87 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4257  hypothetical protein  30.5 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4636  hypothetical protein  30.5 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4343  hypothetical protein  30.5 
 
 
416 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.163869 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12646  hypothetical protein  29.61 
 
 
413 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0318  hypothetical protein  87.5 
 
 
41 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168056  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3852  hypothetical protein  29.5 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4981  hypothetical protein  28.8 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0006  YdjC  22.37 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.925348  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2557  YdjC  23.71 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129817 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2417  hypothetical protein  23.56 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2740  YdjC  23.4 
 
 
333 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1838  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462383  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1772  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1791  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4331  hypothetical protein  26.62 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2014  hypothetical protein  26.52 
 
 
368 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497771  normal  0.553198 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0003  2-acetyl-1-alkylglycerophosph ocholine esterase  25.12 
 
 
295 aa  47  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2658  hypothetical protein  26.38 
 
 
431 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9888  hypothetical protein  30.49 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  26.98 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4418  hypothetical protein  23.65 
 
 
368 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.425813  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  27.78 
 
 
279 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
339 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
275 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.72 
 
 
413 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
279 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4263  hypothetical protein  23.08 
 
 
359 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.440148  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6417  hypothetical protein  28.57 
 
 
336 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 
279 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4574  hypothetical protein  25.84 
 
 
341 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.77 
 
 
279 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>