64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4305 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  100 
 
 		 413 aa  855    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  49.88 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  24.75 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.68 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  25.32 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  27.18 
 
 		 403 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  25.9 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  25.65 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.42 
 
 		 420 aa  107  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.04 
 
 		 463 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.8 
 
 		 474 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  24.94 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  22.19 
 
 		 388 aa  96.7  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.06 
 
 		 448 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  23.93 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  23.32 
 
 		 384 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  28.41 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  24.76 
 
 		 386 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  27.2 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.18 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  24.63 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.14 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  26.7 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  25.06 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  23.69 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  26.01 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  25.83 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  28.21 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  22.44 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.1 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  22.8 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  23.89 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  25.99 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  24.32 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.34 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  23.63 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  22.91 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  25.21 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  25.21 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.62 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.88 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  24.9 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  22.18 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1030  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 		 272 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  25.17 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  25.23 
 
 		 415 aa  53.5  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2062  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.79 
 
 		 314 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.543903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.86 
 
 		 629 aa  53.1  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  25.55 
 
 		 418 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.95 
 
 		 424 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.22 
 
 		 629 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.62 
 
 		 683 aa  47.4  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  21.71 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  25.98 
 
 		 634 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.3 
 
 		 688 aa  45.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.581049  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  24.55 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36290  prolyl oligopeptidase family protein  29.85 
 
 		 609 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.278406  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  33.9 
 
 		 248 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0423  hypothetical protein  26.72 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522254  normal  0.882339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1418  hypothetical protein  28.29 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.554645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.23 
 
 		 642 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 		 641 aa  43.9  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>