61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5182 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  100 
 
 
423 aa  838    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  47.06 
 
 
420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  38.27 
 
 
396 aa  255  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  38.46 
 
 
396 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  39.95 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  37.34 
 
 
463 aa  220  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  35.45 
 
 
474 aa  218  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  36.87 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  33.67 
 
 
448 aa  210  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  37.15 
 
 
417 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  36.25 
 
 
399 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  33.77 
 
 
401 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  33 
 
 
418 aa  179  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  35.73 
 
 
399 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  34.43 
 
 
406 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  26.46 
 
 
388 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  28.22 
 
 
402 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  27.98 
 
 
402 aa  142  9e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.78 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  30.47 
 
 
403 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.95 
 
 
388 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  31.4 
 
 
383 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  29.21 
 
 
387 aa  96.7  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.21 
 
 
357 aa  96.3  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.91 
 
 
402 aa  92.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  31.25 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.74 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.1 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  32.21 
 
 
383 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  37.29 
 
 
376 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  31.22 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.8 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  27.76 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  32.11 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  30.17 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  32.56 
 
 
385 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  28.09 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  31.37 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  31.63 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  23.8 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  27.4 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  27.4 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  24.87 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  30.66 
 
 
386 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  30.57 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.64 
 
 
424 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  25.51 
 
 
386 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  24.61 
 
 
418 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  28.1 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.69 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  25.1 
 
 
315 aa  54.3  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  24.9 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2322  ABC transporter-like protein  31.97 
 
 
876 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.255775 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  32.09 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.58 
 
 
866 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  25.91 
 
 
263 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  24.06 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 
314 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  28.15 
 
 
897 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00330  hypothetical protein  28.45 
 
 
248 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.86 
 
 
358 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>