80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1005 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  100 
 
 		 434 aa  893    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  44.44 
 
 		 474 aa  330  3e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  44.24 
 
 		 463 aa  328  9e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  44.5 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  40.35 
 
 		 448 aa  301  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  43.96 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  38.66 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  39.51 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  38.27 
 
 		 399 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  39.85 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  35.62 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  35.62 
 
 		 396 aa  221  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  35.57 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  34.59 
 
 		 406 aa  192  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  36.87 
 
 		 423 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  29 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  32.18 
 
 		 403 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  28.75 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  29.6 
 
 		 384 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  29.66 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  30.14 
 
 		 373 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  29.38 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  30.6 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.68 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.58 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.12 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.97 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  29.77 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  29.26 
 
 		 420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  28.9 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  28.9 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  29.01 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  29.41 
 
 		 386 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  28.24 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  29.92 
 
 		 386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  23.82 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  29.83 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  29.05 
 
 		 387 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.82 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.51 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  26.65 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  27.94 
 
 		 402 aa  89.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  27.42 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  34.34 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.91 
 
 		 383 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  28.09 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2753  hypothetical protein  32.29 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.272807 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  24.83 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  28.51 
 
 		 318 aa  55.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 297 aa  53.9  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  24.39 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  28.53 
 
 		 326 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  21.37 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  26.2 
 
 		 572 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  26.57 
 
 		 572 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  25.42 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  26.57 
 
 		 567 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  31.85 
 
 		 358 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.76 
 
 		 259 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.39 
 
 		 572 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  36.36 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  29.84 
 
 		 561 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  29.75 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  26.75 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.33 
 
 		 866 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  26.84 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  28.57 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  33.61 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  30.07 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  27.63 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1557  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  23.05 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.198824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3505  bioH protein  40 
 
 		 260 aa  43.5  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  30.2 
 
 		 524 aa  43.5  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 296 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  31.15 
 
 		 330 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36.04 
 
 		 467 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  32.23 
 
 		 318 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>