89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1228 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  826    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  32.27 
 
 
384 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.18 
 
 
434 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.96 
 
 
448 aa  166  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  32.43 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  34.29 
 
 
383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  31.4 
 
 
390 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  31.03 
 
 
463 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  34.11 
 
 
385 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  30.61 
 
 
385 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.51 
 
 
420 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  31.64 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  31.47 
 
 
386 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  28.61 
 
 
396 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  30.59 
 
 
420 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  34.18 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  30.16 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  30.16 
 
 
400 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  31.23 
 
 
387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  30.4 
 
 
406 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  30.15 
 
 
381 aa  132  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  30.19 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  31.07 
 
 
386 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  26.5 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.43 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  31.93 
 
 
417 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.26 
 
 
385 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0541  hypothetical protein  27.47 
 
 
372 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  24.08 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  24.08 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.18 
 
 
413 aa  112  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  29.66 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.51 
 
 
423 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  28.11 
 
 
399 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.58 
 
 
357 aa  102  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  27.51 
 
 
402 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  26.18 
 
 
406 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  27.08 
 
 
400 aa  97.8  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  22.79 
 
 
373 aa  94  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  27.32 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  27.86 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  25.61 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.02 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  24.58 
 
 
406 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.58 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.93 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  26.13 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  24.88 
 
 
418 aa  60.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0325  hypothetical protein  29.49 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0500  hypothetical protein  28.38 
 
 
293 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.754086  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.78 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  28.16 
 
 
300 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  33.07 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  25.12 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  24.17 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  24.17 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  24.17 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25 
 
 
643 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.76 
 
 
259 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  24.89 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  26.11 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  24.89 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  22.86 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.09 
 
 
702 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  27.42 
 
 
326 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.69 
 
 
607 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  32 
 
 
275 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.67 
 
 
646 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  24.88 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  24.76 
 
 
686 aa  43.5  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  25.09 
 
 
615 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.31 
 
 
655 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1126  peptidase S15  27.81 
 
 
335 aa  43.5  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  23.9 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  23.9 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  23.9 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  23.9 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  23.9 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.77 
 
 
317 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.48 
 
 
314 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>