52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B0352 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  99.76 
 
 
414 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  89.13 
 
 
414 aa  787    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  89.37 
 
 
414 aa  789    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 
414 aa  791    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 
414 aa  791    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 
414 aa  791    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  88.89 
 
 
414 aa  784    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  99.76 
 
 
414 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  84.06 
 
 
414 aa  747    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 
414 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 
414 aa  865    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  99.52 
 
 
414 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  89.13 
 
 
414 aa  786    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  89.61 
 
 
414 aa  791    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  89.61 
 
 
414 aa  790    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  65.71 
 
 
416 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  65.23 
 
 
416 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  62.8 
 
 
415 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  66.1 
 
 
415 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  65.06 
 
 
416 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  62.8 
 
 
415 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  64.25 
 
 
415 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  62.8 
 
 
415 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  41.97 
 
 
415 aa  335  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  41.47 
 
 
413 aa  322  9.000000000000001e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  40.1 
 
 
415 aa  316  6e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  39.37 
 
 
415 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  40.24 
 
 
419 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.41 
 
 
357 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  29.37 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  26.51 
 
 
281 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  26.98 
 
 
281 aa  53.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.13 
 
 
438 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.23 
 
 
383 aa  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  26.47 
 
 
301 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  25.13 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  29.75 
 
 
402 aa  50.4  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.41 
 
 
383 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.27 
 
 
381 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.09 
 
 
610 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  26.43 
 
 
299 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  33.08 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.01 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  26.28 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  27.18 
 
 
321 aa  43.9  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.56 
 
 
695 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  29.46 
 
 
512 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  22.28 
 
 
656 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  23.9 
 
 
403 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  27.27 
 
 
259 aa  43.1  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  25.71 
 
 
297 aa  43.1  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>