60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1866 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  71.67 
 
 		 415 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  71.33 
 
 		 415 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 415 aa  861    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  58.94 
 
 		 413 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  44.53 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  44.53 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  44.53 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  45.99 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  43.17 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 414 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 414 aa  338  9e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  43.17 
 
 		 414 aa  338  9e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  42.93 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  42.93 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  41.97 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  41.97 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  41.97 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  41.97 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  41.73 
 
 		 414 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  43.72 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  42.45 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  43.1 
 
 		 416 aa  331  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  44.02 
 
 		 416 aa  330  3e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  43.55 
 
 		 415 aa  329  6e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  41.35 
 
 		 419 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.84 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.85 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.57 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.37 
 
 		 357 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.57 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.34 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  29.71 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.11 
 
 		 383 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  24.83 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  26.79 
 
 		 384 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  25.23 
 
 		 413 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  28.49 
 
 		 390 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  25.46 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  26.74 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.39 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  26.96 
 
 		 255 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  31.85 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  31.88 
 
 		 241 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  28.05 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  25.55 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  23.55 
 
 		 463 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3483  hypothetical protein  25.45 
 
 		 373 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0462629  normal  0.03688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  24.65 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  23.5 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  25.11 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  24.48 
 
 		 386 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  23.67 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  27.64 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  25.34 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  23.98 
 
 		 279 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  26.88 
 
 		 239 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  27.94 
 
 		 442 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>