47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3290 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  72.05 
 
 		 416 aa  641    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 415 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 415 aa  872    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  71.08 
 
 		 415 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 415 aa  872    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  70.84 
 
 		 416 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  68.04 
 
 		 415 aa  588  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  65.62 
 
 		 416 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  65.22 
 
 		 414 aa  585  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 414 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  64.49 
 
 		 414 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  64.25 
 
 		 414 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 414 aa  581  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 414 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  64.25 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 414 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  64.49 
 
 		 414 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  64.25 
 
 		 414 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  63.29 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  63.04 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  63.04 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  62.8 
 
 		 414 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  62.8 
 
 		 414 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  44.53 
 
 		 415 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  41.4 
 
 		 413 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  41.12 
 
 		 415 aa  329  7e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  42.13 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  39.9 
 
 		 415 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.26 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  24.63 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.45 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  22.22 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.6 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  24.17 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.31 
 
 		 383 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09171  conidial pigment biosynthesis protein Ayg1 (AFU_orthologue; AFUA_2G17550)  24.41 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  28.15 
 
 		 386 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  21.86 
 
 		 383 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  25.55 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  22.39 
 
 		 298 aa  46.6  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  26.11 
 
 		 306 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  23.39 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  25.31 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  24.88 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.13 
 
 		 292 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  26.76 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  22.75 
 
 		 388 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>