57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00234 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3368  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  99.76 
 
 		 414 aa  865    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0266  fermentation/respiration switch protein  99.76 
 
 		 414 aa  863    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0271  fermentation/respiration switch protein  99.52 
 
 		 414 aa  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00234  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 414 aa  866    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0765  fermentation/respiration switch protein  85.75 
 
 		 414 aa  756    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3342  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 414 aa  866    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0293  fermentation/respiration switch protein  100 
 
 		 414 aa  866    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0236  fermentation/respiration switch protein  99.28 
 
 		 414 aa  859    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0357  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 		 414 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0359  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 		 414 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000175577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0367  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 		 414 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0352  fermentation/respiration switch protein  89.61 
 
 		 414 aa  791    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0348  fermentation/respiration switch protein  89.86 
 
 		 414 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0284  fermentation/respiration switch protein  99.52 
 
 		 414 aa  861    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.117184  normal  0.397141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00237  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  866    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3288  fermentation/respiration switch protein  65.38 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3303  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 415 aa  581  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000661178  hitchhiker  0.000575901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3290  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 415 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3152  fermentation/respiration switch protein  64.49 
 
 		 415 aa  581  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3435  fermentation/respiration switch protein  64.9 
 
 		 416 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0965  fermentation/respiration switch protein  64.25 
 
 		 415 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0931  fermentation/respiration switch protein  64.65 
 
 		 415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0898  fermentation/respiration switch protein  63.37 
 
 		 416 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  43.17 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0976  fermentation/respiration switch protein  41.19 
 
 		 413 aa  315  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01160  fermentation/respiration switch protein  40.1 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004270  hypothetical protein  40.34 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291288  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  40.67 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.67 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  25.82 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  26.36 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  27.81 
 
 		 281 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  25.71 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.77 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  29.91 
 
 		 281 aa  53.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  27.41 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  29.71 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.27 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  29.1 
 
 		 386 aa  50.4  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.27 
 
 		 259 aa  50.1  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  24.89 
 
 		 403 aa  50.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.07 
 
 		 438 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  27.74 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1112  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.44 
 
 		 656 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245577  normal  0.568355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  25.31 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  30.23 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  25.84 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  26.43 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  28.68 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  29.46 
 
 		 385 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.5 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  28.68 
 
 		 517 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.62 
 
 		 610 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  21.75 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  25.23 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.48 
 
 		 695 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>