147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1933 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  84.68 
 
 		 420 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  78.68 
 
 		 386 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  792    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  78.7 
 
 		 390 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  79.74 
 
 		 386 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  78.18 
 
 		 390 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  64.68 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  57.03 
 
 		 386 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  56.1 
 
 		 385 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  51.58 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  51.58 
 
 		 400 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  51.6 
 
 		 381 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  46.58 
 
 		 387 aa  350  3e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  36.92 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  38.28 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  32.81 
 
 		 384 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  30.61 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.2 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  32.34 
 
 		 406 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  30.4 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  28.14 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  33.93 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.67 
 
 		 474 aa  124  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  28.64 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.65 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.4 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.24 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  26.51 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  32.25 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  28.81 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  32.33 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.4 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  31.85 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  31.47 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.2 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.62 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  28.34 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  25.44 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  32.29 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  26.89 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  25.56 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  23.77 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  23.36 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  21.04 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  25.57 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  28.09 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.38 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.2 
 
 		 626 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.12 
 
 		 626 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.12 
 
 		 626 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  30.86 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  29.58 
 
 		 306 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.76 
 
 		 924 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  26.94 
 
 		 649 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  23.25 
 
 		 630 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.77 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.71 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  24.34 
 
 		 648 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  23.74 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  33.6 
 
 		 316 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  32.31 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.21 
 
 		 656 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  30.25 
 
 		 256 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  28.15 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  28.16 
 
 		 498 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.26 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.03 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.15 
 
 		 575 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  30.43 
 
 		 532 aa  49.7  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  31.85 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.79 
 
 		 642 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 		 676 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.8 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.7 
 
 		 642 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.87 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  23.71 
 
 		 255 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.87 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  26.47 
 
 		 292 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  25.54 
 
 		 399 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  25.9 
 
 		 290 aa  47  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3865  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  28.81 
 
 		 741 aa  47  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3626  hydrolase CocE/NonD family protein  33.93 
 
 		 561 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.09 
 
 		 632 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.61 
 
 		 612 aa  46.6  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.88 
 
 		 677 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.13 
 
 		 683 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.37 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  23.34 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3841  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.68 
 
 		 654 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0129  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.22 
 
 		 665 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286088 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0293  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase  25.96 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.744416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1886  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.2 
 
 		 636 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0358  cinnamoyl ester hydrolase  23.01 
 
 		 281 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  23.88 
 
 		 678 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1688  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0143  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.89 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>