103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5486 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  79.48 
 
 		 420 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  78.18 
 
 		 385 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  803    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  77.66 
 
 		 390 aa  629  1e-179  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  74.09 
 
 		 386 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  74.47 
 
 		 386 aa  608  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  62.34 
 
 		 385 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  57.55 
 
 		 386 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  55.06 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  50.53 
 
 		 381 aa  382  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  48.42 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  48.42 
 
 		 400 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  45.53 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  38.01 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  36.95 
 
 		 383 aa  235  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.03 
 
 		 384 aa  192  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  31.4 
 
 		 403 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  28.53 
 
 		 401 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.2 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  27.35 
 
 		 388 aa  124  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.01 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.45 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  29.87 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.23 
 
 		 474 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  27.5 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  26.78 
 
 		 463 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  29.32 
 
 		 399 aa  96.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  24.38 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  26.18 
 
 		 396 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.41 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.88 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.23 
 
 		 376 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  25.92 
 
 		 396 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  27.51 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  31.73 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  27.64 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  27.83 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  22.92 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.07 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  22.22 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  21.47 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  22.08 
 
 		 378 aa  67  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  23.64 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  29.86 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  23.68 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  28.23 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  25.36 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3141  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.51 
 
 		 596 aa  57  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.91649  normal  0.671974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2955  fermentation/respiration switch protein  29.77 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.283852  normal  0.148271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.45 
 
 		 656 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  23.74 
 
 		 621 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  33.06 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  28.49 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.38 
 
 		 626 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.38 
 
 		 626 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.31 
 
 		 628 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.85 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.23 
 
 		 646 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27 
 
 		 626 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  29.92 
 
 		 258 aa  49.7  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.02 
 
 		 607 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  29.75 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1554  alpha/beta hydrolase fold  26.7 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.23 
 
 		 695 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.94 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3188  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.66 
 
 		 612 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  28.79 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.51 
 
 		 575 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  38.98 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  26.54 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0644  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.45 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.283453 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0864  hydrolase  31.75 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.020243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  30.22 
 
 		 652 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  30.77 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  28.45 
 
 		 261 aa  46.2  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  30.36 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3201  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.28 
 
 		 924 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243991 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.7 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1043  hydrolase  31.06 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.374742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  26.9 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.56 
 
 		 641 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  24.6 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2888  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.37 
 
 		 678 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0760896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  28.3 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  29.3 
 
 		 655 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5132  prolyl oligopeptidase family protein  28.78 
 
 		 654 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  29.11 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2817  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.04 
 
 		 822 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  31.82 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0746  hypothetical protein  31.93 
 
 		 532 aa  44.3  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.2892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  21.03 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  32.69 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  32.69 
 
 		 286 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.36 
 
 		 642 aa  43.9  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  27.78 
 
 		 729 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5090  dienelactone hydrolase  25.99 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.797701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0834  hypothetical protein  21.72 
 
 		 648 aa  43.1  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.386873  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5657  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.49 
 
 		 693 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.56481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  27.39 
 
 		 655 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>