110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3195 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  872    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0856  hypothetical protein  79.47 
 
 		 386 aa  651    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1933  hypothetical protein  84.68 
 
 		 385 aa  693    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2389  hypothetical protein  80 
 
 		 390 aa  652    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4831  hypothetical protein  79.48 
 
 		 386 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.857401  normal  0.718277 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  79.48 
 
 		 390 aa  654    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0906  hypothetical protein  65.19 
 
 		 385 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60282  normal  0.197591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  57.81 
 
 		 386 aa  458  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  54.81 
 
 		 385 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5609  hypothetical protein  52.89 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.675144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5973  hypothetical protein  52.89 
 
 		 400 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0578676  hitchhiker  0.00100227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3412  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  52.13 
 
 		 381 aa  389  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0456561 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3425  hypothetical protein  46.05 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.4734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0478  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  37.44 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2118  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  38.8 
 
 		 383 aa  244  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1547  hypothetical protein  31.5 
 
 		 384 aa  189  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.26317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1228  hypothetical protein  30.59 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.395886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1544  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  28.85 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000180144  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2676  hypothetical protein  28.39 
 
 		 401 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2113  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  30.22 
 
 		 474 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1853  hypothetical protein  30.58 
 
 		 417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0967  alpha/beta fold family hydrolase  27.05 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1005  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.26 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1530  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase related protein  29.12 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4695  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase related protein  31.51 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2308  hypothetical protein  33.89 
 
 		 399 aa  116  8.999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0613  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  30.59 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0890  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  29.15 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.712139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6210  Acetyl xylan esterase  23.56 
 
 		 402 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0736  hypothetical protein  32.33 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3159  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  24.87 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5460  protein of unknown function DUF1100 hydrolase family protein  25.45 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.528765  normal  0.198358 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0716  hypothetical protein  31.9 
 
 		 396 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4476  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  31.46 
 
 		 376 aa  86.3  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1811  hypothetical protein  26.62 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.369907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2957  hypothetical protein  29.44 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.85194  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4305  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  26.7 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0350755  normal  0.767198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4716  hypothetical protein  33.49 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2344  alpha/beta fold family hydrolase  22.9 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.946949  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5182  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  31.41 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0219  hypothetical protein  21.63 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.431687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4482  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  26.3 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0886  alpha/beta fold family hydrolase  23.61 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1275  alpha/beta fold family hydrolase  20.78 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2193  hypothetical protein  22.07 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2165  hypothetical protein  22.07 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4700  hypothetical protein  25.79 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14251  normal  0.0502097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.52 
 
 		 695 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3940  hypothetical protein  26.95 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000344769  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  22.03 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.351879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4575  hypothetical protein  30.99 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.116237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0377  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.2 
 
 		 626 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.280031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  32.8 
 
 		 316 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.39 
 
 		 677 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1006  protein of unknown function DUF1100, hydrolase family protein  26.97 
 
 		 438 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.342716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  26.61 
 
 		 498 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0301  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.3 
 
 		 626 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0345  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.3 
 
 		 626 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  22.65 
 
 		 255 aa  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  32.8 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.42 
 
 		 656 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  22.94 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 		 682 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  40.68 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.37 
 
 		 682 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0333  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.47 
 
 		 717 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.4 
 
 		 621 aa  47.4  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  30.5 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.37 
 
 		 682 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0160  prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 		 655 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  24.66 
 
 		 646 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  30.4 
 
 		 297 aa  47  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  23.38 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0167  prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 		 655 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0165  prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 		 654 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  22.76 
 
 		 630 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 		 677 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.89 
 
 		 683 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  27.61 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  54.76 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0193  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.62 
 
 		 655 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.685951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0187  putative prolyl oligopeptidase family protein  27.34 
 
 		 654 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.89 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  35.11 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.9 
 
 		 607 aa  45.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.98 
 
 		 677 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.88 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0209  putative prolyl oligopeptidase family protein  26.95 
 
 		 652 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0498  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  27.35 
 
 		 575 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0154886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  28.26 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0169  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.38 
 
 		 709 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1866  fermentation/respiration switch protein  27.64 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000738572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  29.2 
 
 		 261 aa  45.1  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1462  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.03 
 
 		 680 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.04 
 
 		 663 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  31.3 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0191  prolyl oligopeptidase family protein, putative  26.43 
 
 		 652 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  29.75 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>