23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1716 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  100 
 
 		 514 aa  1061    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  45.73 
 
 		 449 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  41.89 
 
 		 495 aa  318  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  36.96 
 
 		 478 aa  286  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  34.27 
 
 		 429 aa  193  7e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  34.18 
 
 		 437 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  31.54 
 
 		 430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  32.76 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 1564 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  29.67 
 
 		 399 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  30.39 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  30.4 
 
 		 397 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  27.47 
 
 		 450 aa  125  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  25.6 
 
 		 398 aa  104  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  36.14 
 
 		 536 aa  87.8  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  33.73 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  31.78 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  35.37 
 
 		 1275 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  28.74 
 
 		 615 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.37 
 
 		 2457 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3195  hypothetical protein  40.68 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5486  hypothetical protein  38.98 
 
 		 390 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  27.16 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>