21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6546 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  869    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  49.88 
 
 		 437 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  49.39 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  43.64 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  41.31 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  42.09 
 
 		 1564 aa  303  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  40.35 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  38.11 
 
 		 376 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  34.25 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  34.97 
 
 		 449 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  37.06 
 
 		 495 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  35.11 
 
 		 398 aa  211  3e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  35.52 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  33.59 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  32.85 
 
 		 514 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.36 
 
 		 1275 aa  84.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  25.29 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  34.81 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  28.32 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  31.79 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.75 
 
 		 2457 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>