22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2642 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  100 
 
 		 449 aa  903    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  45.73 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  50.95 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  45.14 
 
 		 478 aa  322  9.000000000000001e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  34.32 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  34.94 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  36.63 
 
 		 1564 aa  216  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  35.75 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  32.89 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  33 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  30.75 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  32.66 
 
 		 398 aa  140  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  37.8 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  28.39 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  30.21 
 
 		 536 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  30.67 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  31.69 
 
 		 376 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  26.5 
 
 		 615 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  33.76 
 
 		 1275 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  26.67 
 
 		 2457 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0714  hypothetical protein  32.89 
 
 		 385 aa  43.5  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3150  hypothetical protein  32.89 
 
 		 386 aa  43.1  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal  0.775857 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>