59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2278 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  40.5 
 
 		 1137 aa  704    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.28 
 
 		 1101 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 1564 aa  3142    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.2 
 
 		 1114 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.82 
 
 		 1088 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.13 
 
 		 1100 aa  602  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.63 
 
 		 1070 aa  569  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  37.04 
 
 		 1347 aa  529  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.02 
 
 		 1139 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.89 
 
 		 1456 aa  516  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.21 
 
 		 1056 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.34 
 
 		 986 aa  490  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 		 1129 aa  492  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  39.32 
 
 		 960 aa  482  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.45 
 
 		 987 aa  479  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.32 
 
 		 961 aa  462  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  54.09 
 
 		 430 aa  460  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  42.96 
 
 		 437 aa  304  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  42.09 
 
 		 421 aa  302  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  36.98 
 
 		 429 aa  274  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  42.67 
 
 		 495 aa  267  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  38.27 
 
 		 478 aa  261  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  36.36 
 
 		 399 aa  258  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  37.22 
 
 		 415 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  36.63 
 
 		 449 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  35.95 
 
 		 398 aa  206  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  26.74 
 
 		 931 aa  182  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  32.21 
 
 		 514 aa  169  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  32.14 
 
 		 450 aa  167  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.57 
 
 		 941 aa  166  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  40.55 
 
 		 397 aa  166  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2279  putative acetyl xylan esterase  33.95 
 
 		 376 aa  165  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  29.08 
 
 		 991 aa  152  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  25 
 
 		 840 aa  144  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.96 
 
 		 954 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  25.39 
 
 		 879 aa  139  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1049 aa  111  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1221 aa  102  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  26.3 
 
 		 615 aa  97.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  30.2 
 
 		 1275 aa  96.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  31.34 
 
 		 536 aa  89.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  23.94 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.54 
 
 		 844 aa  72.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.78 
 
 		 897 aa  66.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  38.05 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  29.94 
 
 		 381 aa  64.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 986 aa  60.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 986 aa  60.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  24.76 
 
 		 2457 aa  58.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 858 aa  57  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  39.33 
 
 		 1319 aa  52  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21 
 
 		 1039 aa  52  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  28.12 
 
 		 899 aa  50.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  21.37 
 
 		 996 aa  48.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  26.72 
 
 		 588 aa  47.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25.3 
 
 		 1163 aa  47.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  29.55 
 
 		 563 aa  47  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2932  hypothetical protein  29.47 
 
 		 399 aa  46.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  21.98 
 
 		 994 aa  45.8  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>