40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2749 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  50.62 
 
 		 1129 aa  1189    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  54.37 
 
 		 1456 aa  1261    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1139 aa  2359    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 1564 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.97 
 
 		 1114 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 1137 aa  492  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.13 
 
 		 1070 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.19 
 
 		 1101 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.31 
 
 		 1088 aa  475  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.15 
 
 		 1347 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.55 
 
 		 987 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.31 
 
 		 960 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.14 
 
 		 1100 aa  419  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.22 
 
 		 986 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.29 
 
 		 1056 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.53 
 
 		 961 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.49 
 
 		 941 aa  170  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  26.34 
 
 		 879 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 931 aa  155  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  24.79 
 
 		 991 aa  154  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  25.44 
 
 		 840 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1049 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.2 
 
 		 954 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1221 aa  89.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  24.84 
 
 		 899 aa  73.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1319 aa  67.8  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.52 
 
 		 844 aa  64.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  23.14 
 
 		 897 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 		 986 aa  58.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  38.55 
 
 		 986 aa  58.9  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  25 
 
 		 1006 aa  57  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1354 aa  56.2  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  30.48 
 
 		 996 aa  55.8  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1208 aa  55.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  25.11 
 
 		 994 aa  52.4  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  25 
 
 		 1163 aa  52  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.93 
 
 		 1039 aa  50.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  36.05 
 
 		 738 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.33 
 
 		 858 aa  47  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  30.95 
 
 		 607 aa  45.8  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>