34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0358 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  45.63 
 
 		 1137 aa  916    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 1114 aa  2297    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  40.2 
 
 		 1564 aa  736    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.61 
 
 		 1100 aa  674    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  69.91 
 
 		 1101 aa  1572    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.22 
 
 		 1088 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  30.48 
 
 		 1129 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.03 
 
 		 1456 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.97 
 
 		 1139 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.45 
 
 		 1070 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.29 
 
 		 1056 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  31.9 
 
 		 1347 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.78 
 
 		 987 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.71 
 
 		 986 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  35.33 
 
 		 960 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.83 
 
 		 961 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 931 aa  199  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  27.12 
 
 		 991 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.66 
 
 		 941 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  27.8 
 
 		 879 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  25.47 
 
 		 840 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  24.85 
 
 		 1049 aa  116  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.61 
 
 		 954 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.85 
 
 		 844 aa  89.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1221 aa  76.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  20.26 
 
 		 897 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  26.6 
 
 		 899 aa  68.6  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.69 
 
 		 1039 aa  63.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1006 aa  60.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 986 aa  54.3  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  29.46 
 
 		 986 aa  54.3  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  22.14 
 
 		 1054 aa  50.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  26.23 
 
 		 996 aa  48.1  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  28.68 
 
 		 1319 aa  46.2  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>