41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3297 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  45.4 
 
 		 931 aa  812    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 941 aa  1946    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  37.93 
 
 		 991 aa  611  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  38.47 
 
 		 879 aa  608  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  38.75 
 
 		 840 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.21 
 
 		 954 aa  261  3e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.82 
 
 		 961 aa  260  9e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.01 
 
 		 960 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.09 
 
 		 986 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.23 
 
 		 987 aa  214  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  27.33 
 
 		 1137 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.88 
 
 		 1114 aa  189  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 1129 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  28.4 
 
 		 899 aa  177  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.42 
 
 		 1101 aa  175  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  28.15 
 
 		 1049 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.49 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  25.57 
 
 		 1564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.1 
 
 		 1070 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 		 1456 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 1088 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.74 
 
 		 1056 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 1100 aa  141  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.43 
 
 		 1347 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20 
 
 		 844 aa  105  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1221 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.46 
 
 		 1039 aa  75.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1006 aa  75.5  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  20.28 
 
 		 1354 aa  73.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1054 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  20.53 
 
 		 996 aa  64.7  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  21.06 
 
 		 986 aa  62.4  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  21.06 
 
 		 986 aa  62  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  19.2 
 
 		 897 aa  60.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  20.34 
 
 		 1319 aa  57.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  21.65 
 
 		 994 aa  53.1  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  20.69 
 
 		 1163 aa  51.2  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  20.11 
 
 		 1325 aa  49.3  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0503  hypothetical protein  29.32 
 
 		 610 aa  45.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1208 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  25.44 
 
 		 588 aa  45.1  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>