41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4096 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  100 
 
 		 1221 aa  2531    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1319 aa  294  6e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1325 aa  224  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1354 aa  206  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  36.1 
 
 		 1208 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.04 
 
 		 1163 aa  203  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.8 
 
 		 954 aa  113  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1006 aa  110  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.27 
 
 		 961 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.92 
 
 		 1039 aa  104  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  22.83 
 
 		 994 aa  103  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.74 
 
 		 1347 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.62 
 
 		 986 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 1564 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1054 aa  98.6  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.03 
 
 		 987 aa  97.4  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.43 
 
 		 1056 aa  96.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  26.33 
 
 		 996 aa  90.1  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.56 
 
 		 1139 aa  89.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  23.13 
 
 		 1137 aa  87.4  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.36 
 
 		 941 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.52 
 
 		 1456 aa  87.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.29 
 
 		 960 aa  85.9  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.04 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.54 
 
 		 844 aa  78.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.39 
 
 		 1101 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.36 
 
 		 1114 aa  75.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.93 
 
 		 1100 aa  75.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  23.09 
 
 		 991 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 986 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  23.66 
 
 		 986 aa  73.9  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  22.35 
 
 		 879 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.17 
 
 		 1088 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.89 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 1129 aa  72  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1049 aa  71.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  21.73 
 
 		 931 aa  69.3  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.7 
 
 		 897 aa  68.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  23.55 
 
 		 1031 aa  63.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  23.54 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  20 
 
 		 895 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>