38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2076 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 1039 aa  2135    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1006 aa  237  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 1031 aa  211  7e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  26.96 
 
 		 994 aa  208  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  27.14 
 
 		 996 aa  207  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1054 aa  204  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 986 aa  180  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 986 aa  180  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1319 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 844 aa  161  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  23.69 
 
 		 897 aa  156  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  22.07 
 
 		 1325 aa  134  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1208 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.65 
 
 		 1163 aa  110  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  21.33 
 
 		 1354 aa  107  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1221 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  20.76 
 
 		 895 aa  95.1  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  20.35 
 
 		 991 aa  85.1  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  21.39 
 
 		 931 aa  77  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.46 
 
 		 941 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.33 
 
 		 954 aa  72.4  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.74 
 
 		 987 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.88 
 
 		 1101 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.02 
 
 		 961 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.69 
 
 		 1114 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  22.25 
 
 		 879 aa  63.2  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1049 aa  60.1  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  21.91 
 
 		 840 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.08 
 
 		 986 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 		 1137 aa  55.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  22.12 
 
 		 1129 aa  55.1  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.51 
 
 		 1088 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.67 
 
 		 1456 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  21 
 
 		 1564 aa  52  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.93 
 
 		 1139 aa  50.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.71 
 
 		 1056 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.35 
 
 		 960 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.68 
 
 		 1070 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>