39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1346 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  100 
 
 		 991 aa  1990    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.59 
 
 		 941 aa  633  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  35.19 
 
 		 931 aa  577  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  37.94 
 
 		 879 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  35.88 
 
 		 840 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.52 
 
 		 986 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.71 
 
 		 960 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.01 
 
 		 987 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.62 
 
 		 961 aa  225  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  31.59 
 
 		 1049 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.25 
 
 		 1114 aa  201  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.01 
 
 		 954 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.18 
 
 		 1101 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.74 
 
 		 1070 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  27.74 
 
 		 1137 aa  174  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.24 
 
 		 1088 aa  168  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.21 
 
 		 1139 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 		 1564 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.59 
 
 		 1056 aa  148  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  32.59 
 
 		 899 aa  146  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.63 
 
 		 1456 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.82 
 
 		 1347 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.23 
 
 		 1100 aa  104  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 1129 aa  98.6  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.09 
 
 		 1039 aa  86.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1221 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  20.83 
 
 		 897 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  26 
 
 		 1354 aa  73.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1054 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  25 
 
 		 1006 aa  66.6  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1325 aa  65.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 986 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  25.11 
 
 		 986 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  22.86 
 
 		 1163 aa  60.1  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1208 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  20.67 
 
 		 996 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.03 
 
 		 1319 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.27 
 
 		 844 aa  46.6  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  24.57 
 
 		 994 aa  47  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>