41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3461 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 840 aa  1737    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  55.34 
 
 		 879 aa  929    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.75 
 
 		 941 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  42.25 
 
 		 931 aa  540  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  35.88 
 
 		 991 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.54 
 
 		 960 aa  196  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.79 
 
 		 987 aa  191  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.13 
 
 		 961 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.12 
 
 		 986 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.14 
 
 		 954 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.47 
 
 		 1114 aa  164  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  27 
 
 		 1137 aa  151  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29680  hypothetical protein  26.31 
 
 		 899 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 1564 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.82 
 
 		 1101 aa  140  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.44 
 
 		 1139 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.07 
 
 		 1456 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 1088 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.38 
 
 		 1100 aa  122  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.55 
 
 		 1070 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.87 
 
 		 1056 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 1129 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1049 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.75 
 
 		 844 aa  92  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.27 
 
 		 1163 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 		 986 aa  89.4  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  22.94 
 
 		 986 aa  87.8  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  37.09 
 
 		 1347 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  26.16 
 
 		 996 aa  82  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1319 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1325 aa  80.1  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1054 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  25.58 
 
 		 994 aa  75.5  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1221 aa  72.4  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  19.03 
 
 		 1006 aa  66.6  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.91 
 
 		 1039 aa  57.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1208 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1354 aa  55.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  23.14 
 
 		 897 aa  52.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  21.57 
 
 		 1031 aa  52.4  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  23.18 
 
 		 895 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>