38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1743 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  60.34 
 
 		 996 aa  1276    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  99.59 
 
 		 986 aa  2020    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 986 aa  2028    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 994 aa  524  1e-147  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  32.15 
 
 		 1006 aa  478  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1054 aa  345  4e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 		 1031 aa  304  7.000000000000001e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.13 
 
 		 1039 aa  180  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.66 
 
 		 844 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  23.19 
 
 		 1163 aa  110  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.1 
 
 		 1319 aa  105  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1208 aa  97.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1325 aa  96.3  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  21.8 
 
 		 1354 aa  92.4  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.94 
 
 		 840 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  20.65 
 
 		 879 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  19.47 
 
 		 897 aa  77.4  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1221 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.68 
 
 		 954 aa  72.8  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37 
 
 		 1100 aa  67.4  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  25.11 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.43 
 
 		 960 aa  63.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.06 
 
 		 941 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 1564 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  29.52 
 
 		 895 aa  59.3  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.55 
 
 		 1139 aa  58.5  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.5 
 
 		 1101 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.46 
 
 		 1114 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  35.48 
 
 		 1347 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  31.37 
 
 		 1129 aa  50.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  22.97 
 
 		 931 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.97 
 
 		 1456 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1100  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1049 aa  48.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  29.47 
 
 		 603 aa  45.8  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  24.02 
 
 		 877 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  24.02 
 
 		 877 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  24.02 
 
 		 877 aa  45.1  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  24.02 
 
 		 918 aa  44.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>