31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2555 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  100 
 
 		 1054 aa  2181    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1006 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  28.19 
 
 		 994 aa  370  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  27.77 
 
 		 996 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 986 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  26.61 
 
 		 986 aa  345  4e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  24.44 
 
 		 1031 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.98 
 
 		 1039 aa  204  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.81 
 
 		 844 aa  142  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  23.65 
 
 		 1319 aa  112  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1354 aa  104  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1221 aa  98.6  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  21.18 
 
 		 897 aa  97.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  21.99 
 
 		 1163 aa  96.3  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  21.31 
 
 		 879 aa  81.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4426  hypothetical protein  19.7 
 
 		 1325 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  23.75 
 
 		 840 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  19.33 
 
 		 895 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8233  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1208 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.42 
 
 		 941 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  21.98 
 
 		 931 aa  70.5  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1346  hypothetical protein  23.04 
 
 		 991 aa  68.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.89 
 
 		 954 aa  64.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1727  glycoside hydrolase family protein  22.44 
 
 		 1137 aa  60.1  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0544172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.83 
 
 		 961 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.87 
 
 		 987 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.32 
 
 		 1101 aa  51.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.14 
 
 		 1114 aa  50.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 1100 aa  49.3  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.34 
 
 		 960 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.03 
 
 		 1456 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>