48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2094 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2094  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  100 
 
 		 844 aa  1731    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000180475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0666  hypothetical protein  24.51 
 
 		 897 aa  205  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000236884  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0915  hypothetical protein  24.57 
 
 		 994 aa  180  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2581  hypothetical protein  23.41 
 
 		 996 aa  178  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.520562  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0165  hypothetical protein  23.75 
 
 		 1006 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2076  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.53 
 
 		 1039 aa  161  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1670  glycoside hydrolase family protein  22.52 
 
 		 986 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1743  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 		 986 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2555  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1054 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.291539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3492  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  23.87 
 
 		 987 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04730  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 1031 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3297  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20 
 
 		 941 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000222307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4235  glycoside hydrolase family protein  22.66 
 
 		 931 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3886  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.19 
 
 		 986 aa  100  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.754835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0942  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.18 
 
 		 960 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000970619 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2269  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.14 
 
 		 961 aa  97.4  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1224  hypothetical protein  22.81 
 
 		 879 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0550391  normal  0.309414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3461  hypothetical protein  22.75 
 
 		 840 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00828066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0358  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.85 
 
 		 1114 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2037  hypothetical protein  19.49 
 
 		 1319 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.178109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4096  hypothetical protein  19.54 
 
 		 1221 aa  78.6  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1521  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.6 
 
 		 1101 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.285241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.06 
 
 		 1056 aa  74.3  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2304  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.41 
 
 		 1070 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0500689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  19.54 
 
 		 1564 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1809  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  19.58 
 
 		 1456 aa  70.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4101  glycoside hydrolase family protein  34.15 
 
 		 1129 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2749  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  21.52 
 
 		 1139 aa  64.7  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0806564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6038  conserved hypothetical protein, putative carbohydrate binding domain protein  20.14 
 
 		 895 aa  62.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.686786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3617  hypothetical protein  20.15 
 
 		 1354 aa  62  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10482  normal  0.364448 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3973  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  20.74 
 
 		 1088 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.4327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3535  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  22.48 
 
 		 1100 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3281  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  19.7 
 
 		 1163 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.667094 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15570  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.75 
 
 		 744 aa  55.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  28.33 
 
 		 588 aa  51.2  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1257  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.17 
 
 		 1347 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618189 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  38.46 
 
 		 587 aa  50.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  41.03 
 
 		 734 aa  50.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  38.67 
 
 		 597 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  36 
 
 		 738 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  35.53 
 
 		 625 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  35.79 
 
 		 604 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  31.82 
 
 		 1129 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  29.7 
 
 		 980 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  36.84 
 
 		 598 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  28.69 
 
 		 923 aa  45.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2133  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 1144 aa  44.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283843  normal  0.156102 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1578  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  18.03 
 
 		 954 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.579068  normal  0.0815371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>